月経周期が不安定になっている原因がわからないので何とも難しいですが、今後就職して仕事中の月経が起こるのを予想できない(準備ができていない)事が起こるかも?とか、妊娠を望んだ際に排卵日など予想が付かずに治療から開始になる、などの可能性くらいでしょうか。
今、大きく不都合を感じることはないかもしれませんが、自分の体のリズムが取れていないようなら、基礎体温などを測定しつつ排卵が起こっているのか、などは様子を見られつつ改善がないようなら受診を検討されてもいいと思います。
長くピルを服用してますが
ピル服用で体質が大きく変わるようなこともないですし
将来の妊娠に影響するようなこともない事は確認されております。
ただ質問者様に合う・合わないもあるので、必要であれば受診時に医師から説明してもらうと安心ですね。