>株式っていうところをクリックして利益を入力して FX で …
はい。
> 配当は税金がいつも引かれてから…
配当は、
(1) 源泉徴収されたままおしまい
(2) 総合課税で確定申告・・・税率が変わる
(3) 申告分離課税で確定申告・・・株で損失を出しときに(FXの損失は不可)
のいずれでもよいことになっています。
https://www.nta.go.jp/taxes/shiraberu/taxanswer/shotoku/1330.htm
(2) を選択すれば、さらに配当控除も得られます。
https://www.nta.go.jp/taxes/shiraberu/taxanswer/shotoku/1250.htm
税金について詳しくは、国税庁の『タックスアンサー』をどうぞ。
http://www.nta.go.jp/taxes/shiraberu/taxanswer/index2.htm