クレーム入れましょう。
相手からの弁明が納得できれば、矛を収めればよいだけで。
各店で異なるのですが、ガラスレンズは小さめに削ってクッション材を入れるところが多いと思います。レンズの一部分だけ隙間があるのでしたら削り過ぎのミスなのですが、一周均等に隙間があり、フレームとの隙間にクッション材が入っている場合はむしろ丁寧な仕事になります。
フレームに傷は、まあ納得できなければ交換を訴えましょう。
あとナイロンワイヤーのメガネはプラスチックレンズでしたよね?
ガラスレンズをナイロンワイヤーで吊っていたのだとしたら、ちょっと怖くて。そのメガネ屋、メガネ屋じゃねーよって思っちゃいます。