お手洗い行って来るね＝会計済ましとけよ？ってことですよね？

そのような解釈は一般的ではありません。\u304a手洗い行って来るね\u306f、その人がトイレにいくことを意味する日本語の表現です。会計の問題を暗に指しているわけではありません。もし会計の確認や支払いを依頼したい場合は、直接その旨を伝える方が明確です。例えば、「会計を確認しましたか？」や「支払いが完了しましたか？」と伝えることができます。