>Windows11にインストール メディアを作成
ということをWindows11のアップデートでは行いません。
初期化するために16GB以上の容量のフラッシュメモリを使用して、Windows11のインストール メディアを作成して使用することは行います。
この場合は「全てのアプリが消える」だけではないCドライブにあるOS、アプリ、データのすべてが消えます。
>今入っているソフト(CLIP studio)のシリアルコードとアカウントを忘れてしまい再インストールができない状態です。
すべて消えるので無関係です。
>1.本当に全てアプリは消えるのでしょうか?
消えます。
>2.CLIP studioのフォルダごと外部媒体に入れて再度戻せばwin11にした後CLIP studioはインストールできるでしょうか?
ライセンス情報は消えないでしょうか?
できません。
すべて消えるだけです。
win11にした後にCLIP studioを再インストールすることはできるでしょう。