まず前提条件としてですが、ギャラリーとフォト、どちらもアプリ内に画像を保存している訳でも同期している訳でもありません、ただファイルとして保存されている画像を表示しているだけに過ぎません
端末内の画像ファイルを表示しているのがギャラリー
端末内の画像とクラウドの画像を表示しているのがフォト
端末内の画像については同じファイルを各々で表示しています
そしてクラウド上のファイルは端末のファイルのバックアップなので基本同じ画像があります
で、ギャラリーから削除すると端末内のファイルだけが削除されますがクラウドのファイルは削除されませんのでフォトからはクラウド上の同じ画像が表示される訳ですね
フォトから削除すると両方削除されるのでギャラリーからも見えなくなる訳です
こうした理屈ですので、ギャラリーから削除してもフォトからは削除されていないように見える(実際はローカルは削除されている)のはギャラリーがクラウドのファイルを扱えないので仕方ない事なのです