大宮工場についての質問ありがとうございます。EF65 500系の機関車に関しては、その外観の変遷について言及させていただきます。
EF65 500系機関車の初期-production時には、屋根は全体的に黒色で塗られていました。これは日本の鉄道路線において一般的な色指定の一つでした。しかし、その後、多くの路線が運転機関の屋根の色を変更し始めました。これは車両の見栄や路線の識別性を向上させるためのものです。
EF65 500系機関車において、パンタ下部を灰色で塗装したのは后来の改修作業の一環でした。これは純粋に外観の美しさを考慮したものであり、屋根全体が黒色の時代とは別個の時期にこのような塗装が行われたということです。つまり、初期-production時のEF65 500系は屋根全体が黒色でしたが、その後の改修でパンタ下部を灰色に塗装することがあり、これは必ずしもセットで行われたわけではありません。
なお、個々の機関車には様々な改修や漆喰工程が行われているため、どの程度の改修工程が行われているのかにより、見た目が異なる場合があります。大宮工場での修理や改修作業にも様々な歴史があり、その中でEF65 500系も様々な変遷を遂げたと言えるでしょう。
ご質問ありがとうございました。他に何かご不明な点があればお気軽にお尋ねください。