セブン-イレブン の出店戦略に合わないからでしょうね。
セブン-イレブン は新規出店する際には「ドミナント戦略(高密度集中出店)」といって配送センターを設けてそのセンターのカバー可能な地域に一気に多数の店舗を開店する戦略を取っています。
とりあえず出店して様子を見るという事はしない訳です。
そして離島は集中出店には向かないので セブン-イレブン は離島にはほとんど出店していません。
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ファミリーマート は地元企業の リウボウ と提携して「沖縄ファミリーマート」という会社を設立して沖縄県に展開しました。