妊娠する為には排卵日付近で行為をしなければなりません。
ちなみに、生理は排卵することで来るのですが、排卵から生理までは約2週間とされています。
行為をした日に生理が来たということは、その時点ですでに排卵が済んでおり、そこから2週間近く経過しているので、妊娠出来る時期ではなかったということです。
極端な話、妊娠しようとしてその日に行為をしたとしても意味がないということです。
仮に、その日が排卵日直前だとしてその行為で妊娠していたとしても、行為から1週間も経過していない時点で妊娠は成立しません。
とにかく、生理がきたのであれば妊娠はしていませんが、それでも不安なら行為から3週間後に妊娠検査薬を試してください。