現在内定をもらっている企業から内定が取り消しは優良企業ならしないと思います。そういったことも見越して採用しているはずなので、内定取り消しは企業側の特に採用担当者の責任問題にまでなってしまうと思います。
正直に企業側に事情を話せば、例えば会社に席を置きながらも大学院に通うなんて措置もあるかもしれません。
いずれにしても退学は今のあなた様の状況にあって無く、留年することが得策と思います。
仮に現在内定をもらっている企業から内定取り消し等があった場合、その様な企業に就職しなかったことをむしろラッキーに思い、別の会社にあたるといいと思います。
捨てる神あれば拾う神ありで、「無用の用」という故事があります様にある会社にとってはいらない人材でも他の企業では必要であったりするものです。