単純にノートパソコン用GPUとデスクトップ用GPUの型番が同じでもノートパソコン用の方がやや劣る、というのは一旦無視して、
すでにデスクトップの値段が跳ね上がっているのと、今出回っているゲーミングノートパソコンは在庫処分的に値段が上がっていないせいで、現在は同じ値段ならデスクトップの方が〜って考え方じゃ買えません。
そういう事情を頭の片隅に置いといて、デスクトップの方が次に買い替える時にパーツ移植だとかでコスト抑えられるだとか、ノートパソコンは放熱でファンがうるさいとか不利な面は確かにあります。
…が、私個人としては、ライフスタイルに合わせてコンパクトなノートパソコンが良いって考え方を支持しますよ。
どうせ将来もっと広い部屋に住む時になった頃にはもっと高性能要求されるようになって買い替える(はず)ので、その時に今度はデスクトップが〜、と考えてみてください