この時期の大門ごとの共通テスト演習は終わってな方も時間で区切るべきですか？

カウントダウンで時間を測り、終わらなくても一旦区切るといいと思います。

その後は模範回答を見ずにカウントアップで測ります。自力で全部解くことが大事です。

ただし、通しでは大問ごとに速く終わる/時間がかかるなど変動があるので制限時間は緩めにしてトータルでかかった時間を記録するのが良いです。