結論から言いますとパスキーにした方が良いですし
今後、認証方法を理由に補償がされない可能性も
無くはないです。
FIDOは総称であり
旧FIDOはU2F
パスキーがFIDO2です
U2Fではパスワードレス認証はできませんので
通信経路上にパスワードが流れます。
ドメイン検証も行われない(もしくは緩い)ので
フィッシング詐欺にも脆弱です。
パスキー(FIDO2)では完全なパスワードレスが可能で
そもそもパスワードを必要としませんので
漏れる可能性はゼロです
ドメイン検証も厳密にされるので
フィッシング詐欺への耐性も強いです。
パスキーがクラウド共有できるというのは
間違ってはいませんが本質はそこに無いです。
U2FもFIDO2も秘密鍵はデバイス内にしかありません。
ただしU2FはあくまでSMS認証よりかはマシな二要素認証でしかなく
パスワードも入力する必要があります。