年末調整後に源泉徴収票に間違いが発覚した場合、どうなりますか？

年末調整の申告内容が間違っているなら確定申告で修正すればよいです。

申告内容が正しくて源泉徴収票が間違っているだけなら会社に言って訂正してもらえばいいです。