明細が消えていてもちゃんと引き落としはされます。
新しい明細金額と、消えた明細金額は別々に引き落とされるかもしれないので合算で入金しておくといいです。
前の楽天カードの番号でログインはできるとしたら前の明細がみれます。
カード切り替えと同じく手動振込先の口座番号も変わってると思うので、新規カードの引き落としに間に合わず手動振込した場合、前のカードの口座に振込まれてしまい新カード未払いとされ再請求されます。その場合は楽天に連絡するしかないです。
前のカードの引き落とし分は前の口座、今のカードのは、今の口座に落ちていくので、そこだけ気をつけるといいです。