転職するべきかの相談です。新卒2年目です。前職は臨床検査技師として検査センターで微生物検査をしていましたが、精神的な面で体を壊し1年で辞めてしまいました。今は病院で働いており、大体1年くらい経ちます。月収30万前後をもらってますが、微生物検査の仕事がなく、微生物検査のあるところへ転職を考えてますが、月収が約5万弱減りそうです。1.やはり短期で転職を繰り返すと人事として評価は下がるでしょうか？2.仮に現在のところを数年勤め続けるとして、今後転職の際に微生物検査に配属される、もしくは教育はしてもらえるものでしょうか？

転職せず継続するのが第一候補になると思います。現在の待遇は恵まれています。
仮に転職しても希望通りにはならない可能性があり、かつ給与面のリスクもあります。
そもそも臨床検査技師って、微生物検査だけが仕事でないはずです。

検査技師は保守系の色合いが濃いので、転職先(技師長)によっては短期離職は不利になる可能性があります。
検査技師なら一通り何でも大丈夫ですと言えるレベルにならないと、一人前とは見られないことがあります。
仕事なので、自分の希望通りにならないことはよくあることで、その辺の大人の割り切りができないと今後も正直厳しいと思います。
尊敬できる技師長や先輩に巡り会えれば良いのですが。。。

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医療系は癖が強いので、仕事の内容より実際は人間関係や職場環境の原因でやめる人が多いです。
以下は興味なかったらスルーしてください。もし一つでも今後のご参考になることがあれば幸いです。

@職場の人間関係なんてどうでもいい(精神科医5分)
→職場だけでなく普遍的な人間関係の法則です。敵は1割、味方は2割、残り7割は無関心(ユダヤの格言)
https://youtu.be/60PyhtqcozE?si=bmrgO2dRPPbfeA62

@メンタルを弱くする5つの習慣(しあわせ心理学13分)
→ 他人の評価をうのみにする習慣、人と比較して凹む習慣、どうにもならないことで悩む習慣など
https://youtu.be/qqoOV5W-0Is?si=oOH8yfWrdp3hqE_I

@自信のない人の3つの習慣(しあわせ心理学 13分)
→自分に自信のない人は共通の理由があります。人から「どう思われるか」が怖いなど
https://youtu.be/RY-scXc_o8k?si=zXVc8s8Wd2eIgAuHn