ファイルを上書きさせないようにサイトやページごとにフォルダを作り階層化させたほうが良いです。
たとえば 知恵袋なら
yahoo.co.jp/">https://chiebukuro.yahoo.co.jp/
この質問のURLリンクなら
https://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q13322941173
フォルダ
『chiebukuro.yahoo.co.jp』
として下の階層に
カテゴリー
『HTML』
さらに下の階層に
『q13322941173』
を作成します。
これなら管理しやすいです。
Webページ、サイトをダウンロードしてくれるアプリやコマンドでも同様で上書きしないように設定すれば間違いありません。まずはフォルダ階層、ファイル管理が出来ていれば失敗しません。