中学生3年生です。私は将来東京の大学に行きたいと思っています。地元の大学に行くよりお金ってかかりますか？

もちろんかかります。

学費は地元でも東京でも同じだとしても、あなたが一人暮らしするための費用が余計にかかりますから。

なるべく安い学生寮のある大学を選ぶとかね。