PayPay銀行の給与受け取り口座特典は、勝手に判断されるのですか？こっちから変更したよと連絡必要ですか？急ぎ、送金無料特典を利用したい場合はどうすればいいですか？

PayPay銀行には申請不要です。

会社給与の振込の際「「給与・キユウヨ・キュウヨ・給料・キユウリヨウ・キュウリョウ・キウヨ」のいずれかの文言が入っていればシステムで自動判定となります。給与振込ですからおそらくこの文言が入っていると思いますが、念のため会社に確認した方が確実ですね。