オンライン決済では使えるプリペイドカードと使えないプリペイドカードがあります。御利用のプリペイドカードのHPで御確認ください。ちなみにVISAやJCBなどのデビットカードなら全部使えるみたいです。
ただしプリカやデビカでのオンライン決済の場合には予約サイトのクレジットカード決済日とは違い予約完了時点で即時決済になります。よって予約キャンセルの場合にも、クレカの場合には締め日のタイミングでは相殺される場合でもプリカやデビカの場合には返金処理になるので、例え予約とキャンセルが同日内に行われたとしても御利用のカードに返金までに締め日のタイミングによって１〜３ヶ月かかると言われています。
【JALじゃらんパック】デビットカードのご利用について
https://recruit-help.jp/jjp/s/article/000022983
ちなみにyahoo!トラベルではPayPay残高払いでもオンライン決済と同額の割引がされます。またキャンセル無料期間内にキャンセルした場合は即日PayPayに返金されます。ただしPayPay残高払いでもクレカ登録必須ですが、デビカやプリカを登録出来ます。またPayPay残高払いに対応していない宿もあるようですので確認を。
質問者さんは予約初心者さんぽいので、一応の補足ですがキャンセルポリシーなどもしっかり確認しましょう。
