ポケモンzaのランクバトルは普段手持ちで使ってるポケモンはランクバトルをやるたびにいちいち手持ちからボックスに移動しないとダメなんですか？ランクバトルのチーム登録はずっと登録されたままではなく毎回登録しなおさないとダメですよね？

手持ちからそのまま参戦することも出来ますよ。

ただ、対戦ルールに合わせた人数に調節する必要があり、現在は3匹ルールなので、3匹ボックスに戻す必要はあります。チーム登録は、手持ちに移動したり、ステータスを変更すると解除されてしまいますね。