牝馬の当て馬(牝馬が牡馬を発情させる)もいますか？また牡馬の当て馬に比べてどの位の割合で用いられますか？

いませんよ？
牡馬は一年中OKですが、牝馬は発情時期が決まっていて、だからこそ当て馬(牡馬)が必要となるんです

まあ、特定の牝馬にしか興味を示さない種牡馬(ウォーエンブレム)に最初好みの牝馬をあてがい、種牡馬をやる気にさせてから他の牝馬にすり替えて種付けさせた、なんて事例はありますが、それはあくまで例外です(‘_‘？