googleパスワードマネージャー側に「1サイト1アカウント」のような制限はありません。
ヤフー側の手順に従って登録すれば、ひとつのgoogleアカウントに同じサイトの複数のアカウントのパスキーを登録出来ます。
googleパスワードマネージャーでのパスキーは、
指紋による暗号化の補助的な解除
↓
画面ロックに使用するパスワード・暗証番号(PIN)・パターンのいずれかによる暗号化
↓
パスワードマネージャーに登録されたパスキー
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登録先のWebサイト
という仕組みなので、利用している人は必ず画面ロックを使い、その補助として指紋を利用しています。
赤外線を使った3D認証のiphone・パソコンとは異なり、Androidの顔認証はただの内カメラによる画像認証でセキュリティが弱いので、AIがどーたらで特別に強化されている8以降のPixelを除き、パスキーの解除に顔認証は使用出来ません。
なお、googleアカウントにログイン出来なくなると連鎖的にパスキーを利用している各サイトのアカウントにもログイン出来なくなるので、googleアカウントの管理には特に気を付けてください。