一緒です。
買い方のおすすめとしては、新幹線の見学をされる際は新幹線自動券売機で、在来線を見学される際は、在来線の自動券売機で入場券を購入されることをお勧めします。
ただ、会社が分かれている区間では入場券の効力は異なりますので、ご注意ください。
例:金沢駅
金沢駅にはIRいしかわ鉄道、北陸新幹線の改札があります。
IRいしかわ鉄道の入場券で北陸新幹線を見学することはできません。
また、反対に北陸新幹線の入場券でIRいしかわ鉄道の電車等を見学することはできません。
基本的に上記の方法で購入されることをお勧めします。
分かりやすく、間違えにくいと存じます。