メルカリで返品をすることになったのですが、コンビニで現金払いをしたのですが、お金はどのように戻ってくるのでしょうか？

要点を言えば、現金は返って来ません。

売上金として返ってくるので、自身で手数料を払い、振込み申請すると現金として引き出しが可能です。