1月の有給を12月頭に4日位申請（連日ではなく飛び石で）したのですが、全部却下されてしまいました。よくあることなのでしょうか？

有給を却下されたのではなく貴方自身の意思で消化しないだけです。そもそも貴方が自社のストライキに参加する場合を除き会社に有給の拒否権有りません。よって会社が正当な理由で時期変更権を行使する場合を除き会社が何喚き散らそうが堂々と有給申請し休めば良いだけです。