上から順にお答えします。
①番兵に発見されてる状態で再起した場合は距離的に捕まると思います。
②仲間のステータスや呪文、持ち物を開いてる時は止まってます。
③再起した場合はHP、MP、SP、持ち物は全て戦闘前の状態に戻ります。
(状態異常やバフ効果は除く)
また、一部攻略サイトやX(旧Twitter)でも色んな方が仰っていると思いますが、今現在ゲーム内で様々なバグが起こっている状態です。(おそらくVer1.21.0以降から?)
端末や機種にもよると思いますが、現状ではバグや不具合という可能性も十分ありえると思います。