会社がパワハラ認めて謝罪してるにも関わらず慰謝料は拒否しており顧問弁護士から直接メール連絡しますって良くあるやり方ですか？

なんか回答が様々ですね…

慰謝料というのは迷惑料のようなもので、「これを支払えば受けた精神的苦痛は勘弁してやる」という物です。
これを拒否されているのですから、貰うには訴訟して慰謝料請求を認めてもらうしかありません。認められない場合は請求権そのものを失うだけ。

他の回答者は慰謝料請求に至った原因を背景に請求権について私見を述べていますが、判決が出るまで誰も断定的なことは言えません。無論、現段階では請求権も有しており請求自体に異論を唱える回答も間違いだと思います。