結論から申し上げますと、確定申告をしても「損をすることはないので安心してください」。むしろ、バイト代から少しでも所得税が天引き（源泉徴収）されているなら、申告によってお金が戻ってくる「得」しかありません。
まず、「20万円以下は申告不要」というのは所得税だけのルールです。しかし、実は住民税にはそのルールがなく、本来は10万円の所得でも役所に申告が必要です。あなたが確定申告をすれば、税務署から役所へデータが飛ぶため、別途住民税の手続きをする手間が省けるというメリットがあります。
気になる住民税の増額ですが、副業10万円に対する住民税は約1万円（税率10％）です。これは「申告したから損をする」のではなく、稼いだ以上には必ずかかる経費のようなものです。もしバイト先で所得税が引かれていれば、確定申告で数千円が還付されるため、結果的に住民税の負担を軽くできます。
「真面目に申告して損をする」ことは理論上ありません。唯一の注意点は、副業分の住民税の納付方法を「自分で納付（普通徴収）」にしないと、会社に副業分が通知される点だけです。
