ガンダム閃光のハサウェイキルケーの魔女の本予告ではペーネロペーのコックピットが映るシーンがあり、第1部ではなかった謎の機材がシート後方に積載されていましたがコレの正体がアルゴスユニット(のファンネル)を運用する為の後付けサイコミュユニットの可能性はかなり高いんでしょうか？

はい、その可能性は確かに高いです。ガンダムシリーズでは、予告では示されていない機密機材や謎の装置が登場し、その後の作品で解明されることがよくあります。アビスユニットという名称から推測すると、その装置はアルゴスユニットのファンネルを円滑に動作させるためのサイコミュユニット（後付けシステム）である可能性が高いです。ただし、最終的にどのような装置となるかは作品内の展開次第です。