コメント失礼致します。
基本的にアルバイト（正社員においても）が損害の補填をする場合、故意または重大な過失が求められます。読ませて頂く限り質問者様は故意という面はないと察します。もう一方の重大な過失について、私個人の意見ですが、会社が提示した金額は会社の倒産を著しく及ぼすものではなく、将来的に相手企業との関係が絶たれ会社の収入源に繋がるものではないのであれば基本的に重大な過失に当たるものではないと考えます。
結論と致しましては、損失補填について求められる要件に会社側が満たしてはいないのではというのが私の考えです。しかし会社と労働者側が契約を結ぶ時そのようなことを説明されていた場合そちらに則ったルールが適用される可能性があります。ただ、その質問者様の生活を脅かされるまでの罰金、損失補填の請求は少し疑問に感じております。
ただ責任者に直接問い合わせるのにはかなり勇気がいると思います。かといって労基に行っても動いてくれる確証はないと思います。もし労基に行ける時間や場所であれば一旦その事の整理と今までの補填額や給与明細などがあればその書類などをしっかり残しておいてあれば動いてくれる可能性が上がると思います。もし可能でしたら電話だけでも聞いてみるとよいかもしれません。
最後に、私自身もアルバイト先に疑問を持ちましたが誰かに打ち明けることはできませんでした。質問者様の勇気、そして仕事での責任感は将来必ず役に立つと思います。めげずに頑張って下さい。初めて質問を返させて頂くので至らぬ点、文章あると思います。ご容赦下さい。
ご清覧ありがとうございました。
