こちらが電話した時に、今お時間宜しいですか？とお伺いを立てる際、一瞬で終わるならわざわざ言う必要ないですか？ある程度の時間を要する場合に使うべきであってますか？

逆ですね。今この瞬間の都合を尋ねているので、一瞬で終わる時に使う言葉であり、ある程度の時間を要する場合には使うべきではありません。

ある程度の時間を要するなら、相手の方がある程度時間が取れる必要があるので、「今でなくてもいいので時間が空いたら声をかけてください」と言います。