頭足類は汽水域には例外はもちろんありますが、汽水域には生息しないと見ました。なぜ汽水域にはあまりいないのでしょうか？

元々、海の生物は海水で生活しています。

よって、汽水域に生息したり、対応できる生物の方が少ないです。

軟体動物の頭足類は淡水へ進出することが無く汽水域にも進出しなかったと言えますね。