利用制限を解除してもらう方法はありません。
お知らせの最下部に「メルペイ事務局」とない場合は、「残高」「メルカード」は使えると思います。
「あと払い」の清算は関係ないと思いますが、途中まで操作(チャージして支払う)したら「出来る/出来ない」が分かります。
どうでしたか?
お支払い用銀行口座からの自動引落しを「26日」に設定しているのでしょうか?
残高不足で引落しに失敗した場合も、再引落としが「末日」に実行されます。
https://help.jp.mercari.com/guide/articles/743/
いずれにしても、「31日まで」に清算すれば大丈夫です。
※「あと払い」の支払い期間は、ご利用月の翌月1日~末日まで
延滞にはなりません。