keiさん
国土交通省なんかは採用によって事務系、土木系、建築系…と人事も分かれていてやる仕事の内容も違いますが、
多くの省庁では、事務系の採用でも技術系の採用でもやる仕事に大きな差はなく、人事自体も分かれていないところも少なくありません。
逆に人事がはっきり分かれているところでは、技術系の人事から事務系の人事に移る、というのは関係者の了解が得られれば可能ですが、
その前に、今度質問者さんが入る役所では、事務採用と技術採用で仕事の内容や人事コースがどのくらい違うのか、人事の系統はどうなっているのかをよく観察してから考えても遅くないと思います。