>今年の初めに住民税を1年分一括で払い…
住民税は、4月~翌3月までの分が6月に課税されます。
サラリーマンではないとして、6月から年4回程度の分納ですので“年の初め”に1年分一括払いということは通常ないのですが、6~12月納期分を滞納していたのでしょうか。
いずれにしても、
>去年と今年、ふるさと納税した…
去年分は今年6月に来た納付書に反映されているはずです。
今年は来年6月です。
>ふるさと納税は前年分が今年の住民税から割り引かれるという…
住民税はそうですが、その前に所得税が当年分から控除されます。
当年分所得税とは、3/15 までにする確定申告のことです。