住宅ローン控除２回目で１年目は確定申告、今回は主人の会社で年末調整をしました。源泉徴収票の(住宅借入金等特別控除の額)の欄と(住宅借入金等特別控除の額の内訳)の欄に何も記載がされておらず、還付金も去年と同じくらい(住宅ローン控除で返ってきた分は含まず)だったのですが、これは住宅ローンの控除されているのでしょうか？

昨年の確定申告分は年末調整の差額とは関係ない。

その差額で返金された金額と、今年の年調分が同じという事はローン控除がされていません。

年調の修正を依頼するか、再度自身で確定申告をするしかないです。

税務署から送られてきた「年末調整のための住宅借入金等控除証明書」や、金融機関から送られてくる「残高証明書」は提出しているのか…。