パート勤務です。4月に時給アップした場合は3 4 5月だけでなく、6月までの給料が社会保険料決定に関わるのですか？

はい。4～6月の給与平均で毎年保険料の改定があります（定時改定）

しかし、どこかで固定給が上がり保険料等級2等級以上の差が出ればそこから3か月分の給与の平均値で保険料が再計算され保険料が変わります。こちらは随時改定と言います。

4月で大幅に昇給した人は早ければ7月から保険料が増える仕組みです。