取れます。ただ、応用よりはそれなりに上です。応用は実務経験者であれば無勉強でも合格できることがありますが、安全確保支援士になるとそんな話を聞いたことはありません。それなりに短い期間の勉強での合格はありますが。
それなりには評価されると思いますよ、ここ最近ITセキュリティは以前よりも重要だと思われてきているのを感じるので。ただしあくまでも「それなり」です。安全確保支援士は受験料は安い方ですし、勉強時間、試験の内容においてそこまで大変なわけではありません。その対価としてのそれなりの評価という感じですので、期待はし過ぎないようにしてください。
後、安全確保支援士の試験に合格しても会社が登録料や更新料を払ってくれないのであれば登録する必要はないです。試験に合格していればいつでも登録できるので転職するとしても試験合格として書いておけばいいです。